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Mine: 3pqrCrystal structure of Metarhodopsin II in complex with a C-terminal peptide derived from the Galpha subunit of transducin

関連構造のPDB ID3pxo
分子名称Rhodopsin, Guanine nucleotide-binding protein G(t) subunit alpha-1, RETINAL,... (12 entities in total)
キーワードprotein, retinal protein, photoreceptor, active state, chromophore, G-protein coupled receptor, glycoprotein, lipoprotein, palmitate, phosphoprotein, photoreceptor protein, sensory transduction, transducer, transmembrane, vision, signaling protein, G-protein, transducin, Galpha subunit, membrane, receptor, GTP-binding, myristate, nucleotide-binding, G-protein-coupled receptor, rhodopsin, opsin
SIGNALING PROTEIN
由来する生物種Bos taurus (bovine)
細胞内の位置 [UNP - P02699] Membrane; Multi-pass membrane protein
由来する組織 [UNP - P02699] Retina
ポリマー鎖の合計数2
分子量の合計42999 (詳細は 構造情報のページ)
著者Choe, H.-W. , Kim, Y.J. , Park, J.H. , Morizumi, T. , Pai, E.F. , Krauss, N. , Hofmann, K.P. , Scheerer, P. , Ernst, O.P. (登録日 : 2010-11-26, 公開日 : 2011-03-09, 最終更新日 : 2011-07-13)
主引用文献Choe, H.W. , Kim, Y.J. , Park, J.H. , Morizumi, T. , Pai, E.F. , Krauss, N. , Hofmann, K.P. , Scheerer, P. , Ernst, O.P.
Crystal structure of metarhodopsin II.
Nature, 471:651 - 655, 2011.
PubMed : 21389988 (主引用文献が同じPDBエントリー) , DOI: 10.1038/nature09789
実験手法X-RAY DIFFRACTION ( 2.85[Å] )
他のデータベース情報
万見(Yorodumi) , CATH , FSSP , SCOP , VAST , UniProt ( P02699, P04695 ) , eF-site , PISA , wwPDB/RDF , Pfam ( PF00001 , PF10413 )
検証レポート3pqr_svg.jpg
<非対称単位>
3pqr.png
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3次元構造ビューア
( jV4 / Jmol ) *2 , JSmol で見る

<生物学的単位>
3pqr_BU.png
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3次元構造ビューア
( Molmil ) *3 で見る
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*1) 静止画像は、'Molmil'を使って作成しています。'Molmil'の表面構造(coarse surface)は、UCSF Chimeraのマルチスケールモデルを参考にしています。
     Software extensions to UCSF chimera for interactive visualization of large molecular assemblies.
     Goddard, T.D. et al., Structure 13: 473-482 (2005) [doi:10.1016/j.str.2005.01.006]
*3) 'Molmil' は、PDBjが開発した新しい高性能な分子ビューアで、最新のウェブテクノロジーを使用して、最適な組み込みやユーザ体験を提供します。

        


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