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on 2018-1-17
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Mine: 3ug9Crystal Structure of the Closed State of Channelrhodopsin

関連構造のPDB ID3uga
分子名称Archaeal-type opsin 1, Archaeal-type opsin 2, RETINAL, OLEIC ACID (4 entities in total)
機能のキーワードmicrobialrhodopsin, seven-transmembrane, light-gated cation channel, MEMBRANE PROTEIN
由来する生物種Chlamydomonas reinhardtii
ポリマー鎖の合計数1
分子量の合計39421.4 (詳細は 構造情報のページ)
著者Kato, H.E. , Ishitani, R. , Nureki, O. (登録日 : 2011-11-02, 公開日 : 2012-01-25, 最終更新日 : 2017-08-09)
主引用文献Kato, H.E. , Zhang, F. , Yizhar, O. , Ramakrishnan, C. , Nishizawa, T. , Hirata, K. , Ito, J. , Aita, Y. , Tsukazaki, T. , Hayashi, S. , Hegemann, P. , Maturana, A.D. , Ishitani, R. , Deisseroth, K. , Nureki, O.
Crystal structure of the channelrhodopsin light-gated cation channel
Nature, 482:369 - 374, 2012.
PubMed : 22266941 (主引用文献が同じPDBエントリー) , DOI: 10.1038/nature10870
実験手法X-RAY DIFFRACTION ( 2.3000[Å] )
他のデータベース情報
万見(Yorodumi) , CATH , FSSP , SCOP , VAST , UniProt ( Q93WP2, Q8RUT8 ) , eF-site , PISA , wwPDB/RDF
検証レポート3ug9_svg.jpg
<非対称単位>
3ug9.png
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( jV4 / Jmol ) *2 , JSmol で見る

<生物学的単位>
3ug9_BU.png
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3次元構造ビューア
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*1) 静止画像は、'Molmil'を使って作成しています。'Molmil'の表面構造(coarse surface)は、UCSF Chimeraのマルチスケールモデルを参考にしています。
     Software extensions to UCSF chimera for interactive visualization of large molecular assemblies.
     Goddard, T.D. et al., Structure 13: 473-482 (2005) [doi:10.1016/j.str.2005.01.006]
*3) 'Molmil' は、PDBjが開発した新しい高性能な分子ビューアで、最新のウェブテクノロジーを使用して、最適な組み込みやユーザ体験を提供します。

        


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