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on 2017-3-22
00:00 UTC / 09:00 JST
Summary Structural Experimental Function Sequence Neighbor Download Link

Mine: 5awzCrystal Structure of the Cell-Free Synthesized Membrane Protein, Acetabularia Rhodopsin I, at 1.57 angstrom
'3wt8' から置き換えられました

関連構造のPDB ID5ax0, 5ax1
分子名称Rhodopsin I
機能のキーワードPROTON TRANSPORT, MEMBRANE PROTEIN, RETINAL, WATER CLUSTER, GREEN ALGAE, PHOTOTAXIS, CELL-FREE SYNTHESIS, MICROBIAL-TYPE RHODOPSIN, LIGHT-DRIVEN PROTON PUMP
由来する生物種Acetabularia acetabulum (Mermaid's wine glass)
ポリマー鎖の合計数1
分子量の合計28311.5 (詳細は 構造情報のページ)
著者Furuse, M. , Hosaka, T. , Kimura-Someya, T. , Yokoyama, S. , Shirouzu, M. (登録日 : 2015-07-10, 公開日 : 2015-08-26 , 最終更新日 : 2015-11-18)
引用文献Furuse, M. , Tamogami, J. , Hosaka, T. , Kikukawa, T. , Shinya, N. , Hato, M. , Ohsawa, N. , Kim, S.Y. , Jung, K.H. , Demura, M. , Miyauchi, S. , Kamo, N. , Shimono, K. , Kimura-Someya, T. , Yokoyama, S. , Shirouzu, M.
Structural basis for the slow photocycle and late proton release in Acetabularia rhodopsin I from the marine plant Acetabularia acetabulum
Acta Crystallogr.,Sect.D, 71:2203 - 2216, 2015.(PubMed : 26527138)  (DOI: 10.1107/S1399004715015722)
実験手法X-RAY DIFFRACTION ( 1.570[Å] )
他のデータベース情報
万見(Yorodumi) , CATH , FSSP , SCOP , VAST , UniProt ( G3CEP6 ) , eF-site , PISA , wwPDB/RDF , Pfam ( PF01036 )
検証レポート5awz_svg.jpg
<非対称単位>
= <生物学的単位>
5awz.png
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3次元構造ビューア
( jV4 / Jmol ) *2 で見る
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*1) 静止画像は、'Molmil'を使って作成しています。'Molmil'の表面構造(coarse surface)は、UCSF Chimeraのマルチスケールモデルを参考にしています。
     Software extensions to UCSF chimera for interactive visualization of large molecular assemblies.
     Goddard, T.D. et al., Structure 13: 473-482 (2005) [doi:10.1016/j.str.2005.01.006]

        


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