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on 2017-9-20
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Mine: 5hxbCereblon in complex with DDB1, CC-885, and GSPT1

分子名称Eukaryotic peptide chain release factor GTP-binding subunit ERF3A, DNA damage-binding protein 1, Protein cereblon,... (5 entities in total)
キーワードE3, Ligase, ubiquitin, DCAF, cereblon, DDB1, CRL4, cullin, IMiD, GSPT1, CRBN
LIGASE
由来する生物種Homo sapiens (Human)
細胞内の位置 [UNP - Q16531] Cytoplasm
[UNP - Q96SW2] Cytoplasm
由来する組織 [UNP - P15170] Lung
[UNP - Q16531] Epidermis, and Fetal lung
[UNP - Q16531] Peripheral blood
[UNP - Q16531] Placenta, and Skin
[UNP - Q16531] Amygdala, and Brain
[UNP - Q16531] Liver
[UNP - Q96SW2] Brain
[UNP - Q96SW2] Brain, and Lung
[UNP - Q96SW2] Adrenal gland
[UNP - Q96SW2] Fetal kidney
[UNP - Q96SW2] Erythroleukemia
ポリマー鎖の合計数6
分子量の合計392392.4 (詳細は 構造情報のページ)
著者Chamberlain, P.P. , Matyskiela, M. , Pagarigan, B. (登録日 : 2016-01-30, 公開日 : 2016-06-29, 最終更新日 : 2016-07-27)
主引用文献Matyskiela, M.E. , Lu, G. , Ito, T. , Pagarigan, B. , Lu, C.C. , Miller, K. , Fang, W. , Wang, N.Y. , Nguyen, D. , Houston, J. , Carmel, G. , Tran, T. , Riley, M. , Nosaka, L. , Lander, G.C. , Gaidarova, S. , Xu, S. , Ruchelman, A.L. , Handa, H. , Carmichael, J. , Daniel, T.O. , Cathers, B.E. , Lopez-Girona, A. , Chamberlain, P.P.
A novel cereblon modulator recruits GSPT1 to the CRL4(CRBN) ubiquitin ligase.
Nature, 535:252 - 257, 2016.
PubMed : 27338790 (主引用文献が同じPDBエントリー) , DOI: 10.1038/nature18611
実験手法X-RAY DIFFRACTION ( 3.60[Å] )
他のデータベース情報
万見(Yorodumi) , CATH , FSSP , SCOP , VAST , UniProt ( P15170, Q16531, Q96SW2 ) , eF-site , PISA , wwPDB/RDF , Pfam ( PF03143 , PF03144 , PF03178 , PF10433 , PF02190 , PF03226 )
検証レポート5hxb_svg.jpg
<非対称単位>
5hxb.png
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3次元構造ビューア
( jV4 / Jmol ) *2 , JSmol で見る

<生物学的単位>
5hxb_BU.png
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3次元構造ビューア
( Molmil ) *3 で見る
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FASTA形式の配列情報
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(他のファイル形式 ...)


*1) 静止画像は、'Molmil'を使って作成しています。'Molmil'の表面構造(coarse surface)は、UCSF Chimeraのマルチスケールモデルを参考にしています。
     Software extensions to UCSF chimera for interactive visualization of large molecular assemblies.
     Goddard, T.D. et al., Structure 13: 473-482 (2005) [doi:10.1016/j.str.2005.01.006]
*3) 'Molmil' は、PDBjが開発した新しい高性能な分子ビューアで、最新のウェブテクノロジーを使用して、最適な組み込みやユーザ体験を提供します。

        


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