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on 2017-5-24
00:00 UTC / 09:00 JST
Summary Structural Experimental Function Sequence Neighbor Download Link

Mine: 5irxStructure of TRPV1 in complex with DkTx and RTX, determined in lipid nanodisc

関連構造のPDB ID5irz, 5is0
関連構造のEMDB IDEMD-8117, EMD-8118, EMD-8119, EMD-8120, EMD-5776
分子名称Transient receptor potential cation channel subfamily V member 1, Tau-theraphotoxin-Hs1a
機能のキーワードTRP, ion channel, nanodisc, vanilloid, lipid, TRANSPORT PROTEIN
由来する生物種Rattus norvegicus (Rat) ,Haplopelma schmidti (Chinese bird spider) (詳細は 構造情報のページ)
細胞内の位置 [UNP - O35433] Cell junction, synapse, postsynaptic cell membrane; Multi-pass membrane protein
[UNP - P0CH43] Secreted
由来する組織 [UNP - O35433] Spinal ganglion
[UNP - O35433] Spinal ganglion, and Trigeminal ganglion
[UNP - P0CH43] Venom, and Venom gland
ポリマー鎖の合計数6
分子量の合計317876.4 (詳細は 構造情報のページ)
著者Gao, Y. , Cao, E. , Julius, D. , Cheng, Y. (登録日 : 2016-03-14, 公開日 : 2016-05-25 , 最終更新日 : 2016-06-22)
引用文献Gao, Y. , Cao, E. , Julius, D. , Cheng, Y.
TRPV1 structures in nanodiscs reveal mechanisms of ligand and lipid action.
Nature, 534:347 - 351, 2016.(PubMed : 27281200)  (DOI: 10.1038/nature17964)
実験手法ELECTRON MICROSCOPY ( 2.95[Å] )
他のデータベース情報
万見(Yorodumi) , CATH , FSSP , SCOP , VAST , UniProt ( O35433, P0CH43 ) , eF-site , PISA , wwPDB/RDF
検証レポート5irx_svg.jpg
<非対称単位>
= <生物学的単位>
5irx.png
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( jV4 / Jmol ) *2 で見る
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*1) 静止画像は、'Molmil'を使って作成しています。'Molmil'の表面構造(coarse surface)は、UCSF Chimeraのマルチスケールモデルを参考にしています。
     Software extensions to UCSF chimera for interactive visualization of large molecular assemblies.
     Goddard, T.D. et al., Structure 13: 473-482 (2005) [doi:10.1016/j.str.2005.01.006]

        


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