130365
エントリー 公開中
on 2017-5-24
00:00 UTC / 09:00 JST
Summary Structural Experimental Function Sequence Neighbor Download Link

Mine: 5l93An atomic model of HIV-1 CA-SP1 reveals structures regulating assembly and maturation

関連構造のEMDB IDEMD-4015
分子名称Gag polyprotein
キーワードHIV-1 capsid SP1, viral protein
VIRAL PROTEIN
由来する生物種Human immunodeficiency virus type 1 group M subtype B (isolate NY5) (HIV-1)
細胞内の位置 [UNP - P12493] Gag polyprotein: Host cell membrane; Lipid- anchor . Matrix protein p17: Virion membrane; Lipid- anchor . Capsid protein p24: Virion . Nucleocapsid protein p7: Virion
ポリマー鎖の合計数3
分子量の合計74368.2 (詳細は 構造情報のページ)
著者Schur, F.K.M. , Obr, M. , Hagen, W.J.H. , Wan, W. , Arjen, J.J. , Kirkpatrick, J.M. , Sachse, C. , Kraeusslich, H.-G. , Briggs, J.A.G. (登録日 : 2016-06-09, 公開日 : 2016-07-13 , 最終更新日 : 2017-02-22)
引用文献Schur, F.K. , Obr, M. , Hagen, W.J. , Wan, W. , Jakobi, A.J. , Kirkpatrick, J.M. , Sachse, C. , Krausslich, H.G. , Briggs, J.A.
An atomic model of HIV-1 capsid-SP1 reveals structures regulating assembly and maturation.
Science, 353:506 - 508, 2016.(PubMed : 27417497)  (DOI: 10.1126/science.aaf9620)
実験手法ELECTRON MICROSCOPY ( 3.90[Å] )
他のデータベース情報
万見(Yorodumi) , CATH , FSSP , SCOP , VAST , UniProt ( P12493 ) , eF-site , PISA , wwPDB/RDF , Pfam ( PF00607 )
検証レポート5l93_svg.jpg
<非対称単位>
5l93.png
他の静止画像を見る *1
3次元構造ビューア
( jV4 / Jmol ) *2 で見る

<生物学的単位>
5l93_BU.png
他の静止画像を見る *1
ダウンロード
PDB形式
FASTA形式の配列情報
PDBx/mmCIF形式
(他のファイル形式 ...)


*1) 静止画像は、'Molmil'を使って作成しています。'Molmil'の表面構造(coarse surface)は、UCSF Chimeraのマルチスケールモデルを参考にしています。
     Software extensions to UCSF chimera for interactive visualization of large molecular assemblies.
     Goddard, T.D. et al., Structure 13: 473-482 (2005) [doi:10.1016/j.str.2005.01.006]

        


Copyright © 2007 日本蛋白質構造データバンク