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on 2017-11-15
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Mine: 5wvoCrystal structure of DNMT1 RFTS domain in complex with K18/K23 mono-ubiquitylated histone H3

分子名称Ubiquitin, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, Histone H3.1,... (5 entities in total)
キーワードDNA methylation, Ubiquitination, SIGNALING PROTEIN-TRANSFERASE complex
SIGNALING PROTEIN/TRANSFERASE
由来する生物種Homo sapiens (Human)
細胞内の位置 [UNP - P62979] Ubiquitin: Cytoplasm
[UNP - P26358] Nucleus
[UNP - P68431] Nucleus
由来する組織 [UNP - P62979] Placenta, and Skin
[UNP - P62979] Placenta
[UNP - P62979] Fetal brain cortex
[UNP - P26358] Prostatic carcinoma
[UNP - P26358] Cervix carcinoma
[UNP - P26358] Leukemic T-cell
[UNP - P26358] Cervix carcinoma, and Erythroleukemia
[UNP - P26358] Liver
[UNP - P68431] Blood
[UNP - P68431] Caudate nucleus, Stomach, and Thymus
[UNP - P68431] Uterus
[UNP - P68431] Spleen
ポリマー鎖の合計数4
分子量の合計49116 (詳細は 構造情報のページ)
著者Ishiyama, S. , Nishiyama, A. , Nakanishi, M. , Arita, K. (登録日 : 2016-12-28, 公開日 : 2017-11-15)
主引用文献Ishiyama, S. , Nishiyama, A. , Saeki, Y. , Moritsugu, K. , Morimoto, D. , Yamaguchi, L. , Arai, N. , Matsumura, R. , Kawakami, T. , Mishima, Y. , Hojo, H. , Shimamura, S. , Ishikawa, F. , Tajima, S. , Tanaka, K. , Ariyoshi, M. , Shirakawa, M. , Ikeguchi, M. , Kidera, A. , Suetake, I. , Arita, K. , Nakanishi, M.
Structure of the Dnmt1 Reader Module Complexed with a Unique Two-Mono-Ubiquitin Mark on Histone H3 Reveals the Basis for DNA Methylation Maintenance
Mol. Cell, 68:350 - 360.e7, 2017.
PubMed : 29053958 (主引用文献が同じPDBエントリー) , DOI: 10.1016/j.molcel.2017.09.037
実験手法X-RAY DIFFRACTION ( 1.997[Å] )
他のデータベース情報
万見(Yorodumi) , CATH , FSSP , SCOP , VAST , UniProt ( P62979, P26358, P68431 ) , eF-site , KEGG ( EC 2.1.1.37 ) , PISA , wwPDB/RDF
検証レポート5wvo_svg.jpg
<非対称単位>
= <生物学的単位>
5wvo.png
他の静止画像を見る *1
3次元構造ビューア
( jV4 / Jmol ) *2 , JSmol で見る
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*1) 静止画像は、'Molmil'を使って作成しています。'Molmil'の表面構造(coarse surface)は、UCSF Chimeraのマルチスケールモデルを参考にしています。
     Software extensions to UCSF chimera for interactive visualization of large molecular assemblies.
     Goddard, T.D. et al., Structure 13: 473-482 (2005) [doi:10.1016/j.str.2005.01.006]

        


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