129541
エントリー 公開中
on 2017-4-26
00:00 UTC / 09:00 JST
Summary Structural Experimental Function Sequence Neighbor Download Link

Mine: 5x2hCrystal structure of Campylobacter jejuni Cas9 in complex with sgRNA and target DNA (AGAAACA PAM)

関連構造のPDB ID5x2g
分子名称CRISPR-associated endonuclease Cas9/RNA/DNA Complex
キーワードCRISPR-Cas9, RNA, DNA, Complex, Nuclease, HYDROLASE-RNA-DNA complex
HYDROLASE/RNA/DNA
由来する生物種Campylobacter jejuni subsp. jejuni serotype O:2 (strain ATCC 700819 / NCTC 11168),synthetic construct (詳細は 構造情報のページ)
ポリマー鎖の合計数4
分子量の合計137822.3 (詳細は 構造情報のページ)
著者Yamada, M. , Watanabe, Y. , Hirano, H. , Nakane, T. , Ishitani, R. , Nishimasu, H. , Nureki, O. (登録日 : 2017-01-31, 公開日 : 2017-03-29)
引用文献Yamada, M. , Watanabe, Y. , Gootenberg, J.S. , Hirano, H. , Ran, F.A. , Nakane, T. , Ishitani, R. , Zhang, F. , Nishimasu, H. , Nureki, O.
Crystal Structure of the Minimal Cas9 from Campylobacter jejuni Reveals the Molecular Diversity in the CRISPR-Cas9 Systems
Mol. Cell, 65:1109 - 1121.e3, 2017.(PubMed : 28306506)  (DOI: 10.1016/j.molcel.2017.02.007)
実験手法X-RAY DIFFRACTION ( 2.300[Å] )
他のデータベース情報
万見(Yorodumi) , CATH , FSSP , SCOP , VAST , UniProt ( Q0P897 ) , eF-site , PISA , wwPDB/RDF
検証レポート5x2h_svg.jpg
<非対称単位>
= <生物学的単位>
5x2h.png
他の静止画像を見る *1
3次元構造ビューア
( jV4 / Jmol ) *2 で見る
ダウンロード
PDB形式
FASTA形式の配列情報
PDBx/mmCIF形式
(他のファイル形式 ...)


*1) 静止画像は、'Molmil'を使って作成しています。'Molmil'の表面構造(coarse surface)は、UCSF Chimeraのマルチスケールモデルを参考にしています。
     Software extensions to UCSF chimera for interactive visualization of large molecular assemblies.
     Goddard, T.D. et al., Structure 13: 473-482 (2005) [doi:10.1016/j.str.2005.01.006]

        


Copyright © 2007 日本蛋白質構造データバンク