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on 2017-9-20
00:00 UTC / 09:00 JST
Summary Structural Experimental Function Sequence Neighbor Download Link

Mine: 5xf9Crystal structure of NAD+-reducing [NiFe]-hydrogenase in the air-oxidized state

関連構造のPDB ID5xfa
分子名称NAD-reducing hydrogenase, NAD-reducing hydrogenase, NAD-reducing hydrogenase,... (11 entities in total)
機能のキーワードhydrogenase, Ni-Fe, Fe-S, OXIDOREDUCTASE
由来する生物種Hydrogenophilus thermoluteolus
ポリマー鎖の合計数8
分子量の合計331217.4 (詳細は 構造情報のページ)
著者Shomura, Y. , Taketa, M. , Nakashima, H. , Tai, H. , Nakagawa, H. , Ikeda, Y. , Ishii, M. , Igarashi, Y. , Nishihara, H. , Yoon, K.S. , Ogo, S. , Hirota, S. , Higuchi, Y. (登録日 : 2017-04-09, 公開日 : 2017-08-23, 最終更新日 : 2017-09-20)
主引用文献Shomura, Y. , Taketa, M. , Nakashima, H. , Tai, H. , Nakagawa, H. , Ikeda, Y. , Ishii, M. , Igarashi, Y. , Nishihara, H. , Yoon, K.S. , Ogo, S. , Hirota, S. , Higuchi, Y.
Structural basis of the redox switches in the NAD(+)-reducing soluble [NiFe]-hydrogenase
Science, 357:928 - 932, 2017.
PubMed : 28860386 (主引用文献が同じPDBエントリー) , DOI: 10.1126/science.aan4497
実験手法X-RAY DIFFRACTION ( 2.58[Å] )
他のデータベース情報
万見(Yorodumi) , CATH , FSSP , SCOP , VAST , UniProt ( A0A077L6X8, A0A077L885, A0A077L7R5, A0A077LAI5 ) , eF-site , PISA , wwPDB/RDF , Pfam ( PF01257 , PF01512 , PF10589 , PF10588 , PF13459 , PF13510 , PF01058 , PF00374 )
検証レポート5xf9_svg.jpg
<非対称単位>
5xf9.png
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3次元構造ビューア
( jV4 / Jmol ) *2 , JSmol で見る

<生物学的単位>
5xf9_BU.png
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3次元構造ビューア
( Molmil ) *3 で見る
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*1) 静止画像は、'Molmil'を使って作成しています。'Molmil'の表面構造(coarse surface)は、UCSF Chimeraのマルチスケールモデルを参考にしています。
     Software extensions to UCSF chimera for interactive visualization of large molecular assemblies.
     Goddard, T.D. et al., Structure 13: 473-482 (2005) [doi:10.1016/j.str.2005.01.006]
*3) 'Molmil' は、PDBjが開発した新しい高性能な分子ビューアで、最新のウェブテクノロジーを使用して、最適な組み込みやユーザ体験を提供します。

        


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