135201
エントリー 公開中
on 2017-11-15
00:00 UTC / 09:00 JST
Summary Structural Experimental Function Sequence Neighbor History Download Link

Mine: 5xutCrystal structure of Lachnospiraceae bacterium ND2006 Cpf1 in complex with crRNA and target DNA (TCTA PAM)

分子名称LbCpf1, crRNA, DNA (29-MER),... (8 entities in total)
キーワードnuclease, HYDROLASE-RNA-DNA complex
HYDROLASE/RNA/DNA
由来する生物種Lachnospiraceae bacterium ND2006,synthetic construct (詳細は 構造情報のページ)
ポリマー鎖の合計数4
分子量の合計168777.2 (詳細は 構造情報のページ)
著者Yamano, T. , Nishimasu, H. , Ishitani, R. , Nureki, O. (登録日 : 2017-06-26, 公開日 : 2017-08-09)
主引用文献Yamano, T. , Zetsche, B. , Ishitani, R. , Zhang, F. , Nishimasu, H. , Nureki, O.
Structural basis for the canonical and non-canonical PAM recognition by CRISPR-Cpf1
To Be Published, : - , .
実験手法X-RAY DIFFRACTION ( 2.400[Å] )
他のデータベース情報
万見(Yorodumi) , CATH , FSSP , SCOP , VAST , eF-site , PISA , wwPDB/RDF
検証レポート5xut_svg.jpg
<非対称単位>
= <生物学的単位>
5xut.png
他の静止画像を見る *1
3次元構造ビューア
( jV4 / Jmol ) *2 , JSmol で見る
ダウンロード
PDB形式
FASTA形式の配列情報
PDBx/mmCIF形式
(他のファイル形式 ...)


*1) 静止画像は、'Molmil'を使って作成しています。'Molmil'の表面構造(coarse surface)は、UCSF Chimeraのマルチスケールモデルを参考にしています。
     Software extensions to UCSF chimera for interactive visualization of large molecular assemblies.
     Goddard, T.D. et al., Structure 13: 473-482 (2005) [doi:10.1016/j.str.2005.01.006]

        


Copyright © 2007 日本蛋白質構造データバンク